প্রত্যেক নতুন-পুরাতন শিক্ষার্থীকে অফিস থেকে ফরম সংগ্রহ করে ভর্তি হতে হয়।
ইফতা বিভাগ, ক্বিরাত বিভাগ ও কিতাব বিভাগ এর নতুন শিক্ষার্থীদের ক্ষেত্রে ৫ শাউয়াল থেকে ২৫ শাউয়াল পর্যন্ত ভর্তি কার্যক্রম জারি থাকে। আর পুরাতন শিক্ষার্থীদেরকে ১০ শাউয়ালের পূর্বে ভর্তি কার্যক্রম সম্পন্ন করতে হয়।
হিফজ বিভাগে নির্দিষ্ট কোটা পূর্ণ হওয়ার পর ভর্তি করানো হয় না।
কিন্ডারগার্টেন-এর শিক্ষার্থীদের ক্ষেত্রে ১০ ডিসেম্বর থেকে ১০ জানুয়ারী পর্যন্ত ভর্তি কার্যক্রম জারি থাকে।
ভর্তি ইচ্ছুক নতুন শিক্ষার্থীকে ভর্তি পরীক্ষায় অংশগ্রহণ করতে হয়। পরীক্ষায় উত্তীর্ণ হলে ভর্তি করানো হয়, অন্যথায় ভর্তি করানো হয় না অথবা নিচের ক্লাসে ভর্তি করানো হয়।
ভর্তির সময় প্রত্যেক শিক্ষার্থীর ভর্তি ফি ও চলতি মাসের বেতনসহ আনুসাঙ্গিক সকল ফি একসাথে পরিশোধ করতে হয়।
রশিদ ছাড়া কোন প্রকার লেনদেন গ্রহণযোগ্য নয়।
মেধাবী, গরীব, এতীম ও মিসকীন শিক্ষার্থীর জন্য বিশেষ সুবিধা রয়েছে।